投稿を見る限りでは、顧問の先生はあなたの本意を見抜いていると思います。あなたは理由をいくつか挙げていらっしゃいますが、本当に優先順位をつけるならどれが一番なのでしょうか。
部活での楽器についての不満が一番なら、新年度を機に変更を希望するのも一つです。ただし、初心者なら一年下の人たちと同じレベルでやるわけで、それは大丈夫か。今までやってこられた楽器については、好きでなくてもそれなりの技術があると思いますから、気持ち次第ですが、それを活かして後輩に教えたりして活動することができるでしょうね。
楽器に関わらずつまらない、辞めたいのが一番強いのであれば、相談して辞めてもいいと思います。ただ、辞めた後に、やっぱり辞めなければよかったと思っても戻れません。部員たちとの関係も変わるかもしれません。その後どうするかをしっかり考えて実行することが一番大事ですね。流されて何事も曖昧になってしまう場合もあります。
あなたのご家族の方は知っているのですか。もしまだならご家族にもちゃんと相談をして、責任をもって決めたらいいと思います。
納得のいく決断ができるといいですね。