>>やはり生徒からこんな手紙を送り付けてしまったのは迷惑だったでしょうか？
→「勉強以外でもいいから相談して」と言ったのは先生のほうなので、生徒である質問者様が相談して迷惑だったかどうかを気にかける必要はないと思います。
実際に親身になって相談を受けてくれたのであれば、自分の言ったことに対して責任をもって応じてくれたのですから、責任感のある良い先生だと思います。
そういった先生に出会えて良かったですね。

>>やっぱり身体が弱くて涙脆い生徒よりも、明るくていつもポジティブな生徒の方が魅力的だったのではないか…と自分から相談したくせにもやもやしてしまいます。
→質問者様のなかで「先生に相談すること」が、だんだん「先生とただ話をすること」に目的が変わってしまっているように思えたのですが、いかがでしょうか？

もし、今後もその先生に生活相談をするのであれば、恋愛感情は抜きにして関わったほうが良いと思います。
それが出来ないのであれば、生活相談の相手をスクールカウンセラーや保健室の先生など別の人に変えたほうが良いと思います。

相談と恋愛は両立しないので、下手をすれば今後、質問者様の知らないところで何かしらのトラブルが起こることも考えられます。

以前、見たニュースでは、とある教員と生徒が結婚を前提に真剣交際をしていたところ、学校側がそれに気づき、その教員をクビにしたことが報じられました。
「クビにするようなことか？」とも思いましたが、実際にそのようなことが現実に起きているので、質問者様も十分お気をつけください。

こうしたトラブルを未然に防ぐためにも、生活相談と恋愛感情はなるべく切り離してお考えになられたほうが良いように思いました。

結局のところ、ご自身がその先生とどういった関係性でいたいかだと思います。
他の人が見て誤解されるようなことはしないほうがお互いのため、ということだけは忘れないでください。

私も高校生時代に片思いをしていた先生がいましたが、卒業と同時にその先生がご結婚されたと聞いたのを回答しながら思い出しました。