可愛い人と美人な人は私にはなんだか別質に思えるので分けても良いでしょうか？

まず、なぜ可愛い人は性格がいいか。
おそらく「人当たりが良い」ということが「可愛い」に繋がっていると私は思います。
もちろん全ての可愛い人が誰にとっても可愛いとは言い切れませんが、みんなに「可愛い」という評価を受ける人は「性格が良いから可愛く見える」のではないでしょうか？
そもそも「可愛い」って思う相手って、人に弱みを見せることにあんまり抵抗がなかったりして周りの人を頼ったりすることが上手です。そして頼りっぱなしでなくリターンできるものでリターンします。すると「良い子だなあ」と思われる構図が出来上がります。
まず頼る。知らない人にも（道を聞いたりとか）頼る。話しかける。
それが出来るってすごく勇気が要ることを率先して出来る人でもあるし、たくさんの人と会話することになるから場数（経験値？）も踏める。
そうして自分にとって良い人、嫌な人に対する対処を知っていくようになっていくし、頼った数だけ友達が増えるようになっていく。
笑顔を欠かさなかったりも大事だし、空気も読める。
大変なことがあっても明るい。
そういうことを踏まえるとそれって「性格が良いから可愛い」のではないでしょうか？

さて次に、美人な人が性格が良いのはなぜか。
「美人」とは「顔が綺麗」「スタイル良い」など見た目が主な理由でそう見られることが多いと思います。
みんな、いろんな人が「美人」であるために寄ってきて大変です。
寄るまで行かずとも視線はいつも浴び続けることになるでしょう。超目立つんです、きっと。
関わる人が普通の人より多くなってしまい場数を踏みます。自分に対して「性格悪い」と評価をつけられることもありますがそれを修正するように頑張ります。そして性格の悪いところを改善し、評価を改めてもらったり新たに良い評価を受けたりします。
そういう流れからいくと、もしかしたら最初から性格が良いかというとそうではない人なんではないかなと想像します。（「可愛い」人よりは、ってくらいの違いですけどね。）
性格自体は元は普通なのに、コミュニケーション取る機会が多くて後で自分の性格を少し修正する必要があったという感じでしょうか？
中には「美人」と言われながら性格をあえて修正しない人も出てくるでしょうね。でも「美人だね」とか言われたら「そんなことないよ」って返す必要があるから言うようにしてるし、それを本心で言ってのける方が性格良いからそう思うようにしてるってのは頷けませんか？

最後に、ブスが性格悪い理由。
ブスだって性格悪くない人はいます。もちろんいます。
中には「ブスであるから性格良い羽目に陥ってる」人もいそうです。そういう人は仏のように全てを受け入れられる人に限りますけど。
ではなぜ性格が悪いか。
自分の見た目に大きな欠点があると考えているというのが出発点でしょうね。
そしてその欠点は普通は隠したがるものです。それを見られさえしなければもっと大胆に人と新たに会うことができますが、それをまずしたがらない傾向にあるでしょう。
そうでなくても隠したいのは一緒。隠している人もいますし、当てはまらないかと思われますが、何と言ってもその欠点は元々人目につきやすい。自分の弱いところを指摘されたり馬鹿にされたりして傷ついていきますが、その欠点はそう簡単に解決しない。何より見た目の問題が多いですからね。
さらに傷口に塩を塗るのが、自分の欠点箇所に欠点を持っていない人の存在です。それは、嫉妬やひねくれやなんかの心の問題を引き起こします。
欠点を普段は隠している人でも「この人はこの欠点を持っていない」「あの人はこの欠点を持っている」の判断基準が無意識にできてしまっているので、心の問題を回避できるとは言えません。
そこから人を差別したり悪口を言ったりする攻撃に発展してしまったり、「自分なんか」と卑下して自分より「上の人」と「下の人」を作りだしてしまったり、多岐にわたるブス行為についつい陥ってしまいます。
ブスな人は会話の場数を踏むとかできないうちにこうなってしまうことが多いのではないでしょうか？

多分こんなところでしょうね。