おつらいですよね；；
25年前に私も同じ様な状態になりました。約5年間皮膚科を8件回っても、大学病院でも「わかりません」でした。足も手も水疱が最初にでき、皮がむけてボロボロになります。菌はみつかりません。そのうち爪まで変形してきてしまい、手袋と靴下がかかせませんでした。困っていた時にNHKの健康番組に出ていらした女医さんを訪ねると、当時珍しい「掌蹠膿疱症（しょうせきのうほうしょう）」と言われました。原因は今もはっきりしていないそうです。
歯に詰めた金属や歯周病の場合もあり、のどが腫れやすい体質なので思い切って入院し、扁桃腺を2つ取りました！　その間は「ビオチン」「ミヤBM」を処方されていましたが、扁桃腺跡が完治した時に治ってしまいました。
ちなみにこの病いは、絶対禁煙が必須です。
見た感じですが、当時の私よりひどくないですよ＾＾　なるべく良い皮膚科専門医を探して、通院してみてくださいね！　治りますよ！
(他の病気の場合もありますし、ぜひ通院を頑張って下さい）