皆さんご回答ありがとうございました！
1つ1つ大切に読ませていただきました。
最後に1つだけ質問させてください。

実はもう一度考えさせてもらって、やはり違和感があるのならやめようと思い会うのを断ったのですが、そうしたら
「色々考えてくれてありがとう。今まで出会った中でもかなり素敵な人だったから幸せになってほしい！元気でね」と言ってくれました。

付き合った人数は人並みにいらしたのでそこまで女の子に慣れてないわけではないと思うのですが、理系の方で職場も男性ばかりとのことで、空回りしたり私の誤解の部分もあったのかなと思い「慎重な性格で疑っちゃってごめんね」と伝えたら、
「アプリ怖いのは仕方ないよ。でもその真面目で慎重な性格含めて素敵だなと思う！もしよかったらまた電話とかできたら嬉しいな」と言われ、
そこまで引き止めるということはヤリモクではないのかなと思い（ヤリモクや軽い人なら他に女の子沢山いるからわざわざ私みたいなめんどくさいタイプに固執する必要ないと思うので）
「慎重だから時間かかっちゃうかもだけど、それでもよければまたお互いのこと知って行けたら嬉しいな」と伝えたら、私のペースで大丈夫だよと私の気持ちを尊重してくれました。

正直違和感は感じましたが、彼へのイメージが少し変わってきています。私が利用しているアプリは性格診断があるのですが、その性格は確かに私に似ている傾向ではあります。
2回も会うの断ったのに、これは私のことを本当に素敵だと思ってくれてるから時間をかけてもいいと思ってくれているのでしょうか？

皆さん自分の直感を信じてと言ってくださったので、今のところとりあえず会わずにLINEや電話を続けてみて判断しようと思ってます。

そして質問なのですが、もしまた会おうという話になったら、きっと来れるよねと決めつけられたのが悲しかったと伝えてもいいのでしょうか…？正直これが一番気になってて、でもまた私の誤解があったら申し訳ないなと思って。

もしかしたら、お昼に東京で予定があって移動すると時間がかかって会うの遅くなるから、その近辺で会えたらなと思い何も考えずにポロっと発言したのかなと思ったりもしました。
（良い方に考えすぎですかね…）

皆さんは第一印象が変わった経験はありますでしょうか？

こんな長文を読んでいただき本当にありがとうございます。泣
自分で決めるべきことであるのに、2度も質問してしまいすみません。
正直アプリの話なので周りに相談するのも恥ずかしく、ここの方々はいつも親身になってご回答してくださるので皆さんの意見が聞きたく質問させていただきました。