お辛いですね。私も軽度ではありますがアトピー持ちで、社会人になってから再発したりで辛い時期もありました。
ひと口にアトピーと言っても原因は様々で（結局はアレルギーなので）、合うものも人それぞれなんですよね。
塗り薬は使えていますか？　もしかしたらステロイドに忌避感があるかもしれませんが、私としては一番確実に効くのがステロイドだと思っています。
「ステロイドは怖いもの」だと思っていると使用量を少なくしてしまうのですが、実は塗り薬にも飲み薬と同じで要量があるんですよ。人差し指の先から第一関節までの長さで、手のひら二枚分を塗る。というのが塗り薬の正しい要量です。やってみたら分かりますが、思っているよりずっと多いです。ご存知かもしれませんが、一応参考までに。
甘いものでも、発酵食品はどうですか？　腸内環境が荒れると肌も荒れるので、甘くて美味しいヨーグルトとか乳酸菌飲料ならどうでしょうか。
少しでも息子さんが楽になりますように。