まず、あなたは事前に「合理的配慮をして欲しい」旨をお宿にお伝えしていたのでしょうか。

もし、それをせずにキャンセル後にお宿からの連絡を受けて、

＞病気（障害者手帳二級を持つ私は、予約をしていても身体の調子が無理だと思う時は早めにキャンセルをしていました）の件をお話し

したのであれば、それはお宿からすれば「寝耳に水」だと思います。

わたしは障害のある人が合理的配慮を要求することは全く悪い事だとは思いません。
ですが、ご自身からきちんとそれをお願いをしない事には「相手はあなたの障害について知らされていない」のですから、「どのような配慮をすべきか」も知る由がないのです。

文章からすると、2ヵ月前に予約をして5日前にキャンセルをしたということですよね。
その点についてのお宿のプライバシーポリシーは何と書かれていましたか？

基本的に「如何なる理由であってもキャンセルには損害が発生する」ものなのですが、「事前に合理的配慮について知らせることもなく、キャンセルも理由を告げずに行い、お宿からの連絡(出禁)を受けてようやく事情を説明した」のであれば、お宿よりもあなたの方に問題があるとも言えます。

あなたの書かれている情報だとあなたの視点から一方的に書かれているだけなので、全体像が分かりづらいです。
故にお宿側がどのように差別的で、非が本当にお宿側だけにあるのか、懐疑的にならざるを得ません。