想い
クラスの問題ではないと思いますよ。

ただ、
＞学校で友達に（みゆうちゃんの事どう思ってる）って聞いてもらったのですが

とありますが、こういうことを間接的に聞かれると年頃の男子は恥ずかしがってしまいますし、「普通」という答えが普通な気もします。
「友達として好き」という答えよりもストレートで、クセのない答えだなって思いますよ。

クラスが離れたら顔を合わせることが少なくなってしまいますがメールもされているようですし遊んだりもしてるんですよね？
でしたらクラスは関係なくて何の隔てもない中で主さんのことを「友達」と思っているのではないかと思いますよ。

両想いは必ずなれるものではないけれど、それが恋ですよね。
今は想うことを大事にして、自分なりのペースで相手を追い込めない程度のアプローチをしていくと相手の負担にもならず、いい意味で意識してくれるかもしれません。
一緒にいると楽しい相手とか、かっこつけなくてもいい相手だとか、裏表のない相手だとか、そういう友達を経ていたからこそ知れたことが「好き」という気持ちを生むと思いますよ。