私が利用したのは
セブンイレブンのセブンネットショッピングです。
ネットで会員登録(無料)した後注文→数日後自分で指定したお店に入荷→そのお店に行って支払い＆受け取り…この場合、送料や手数料はかからなかったと思います。
※最後に利用したのが結構前なので記憶が曖昧ですいません。

後、Amazonならローソンやファミリーマートでの受け取りができますよ。
こちらは利用した事がないので、送料や手数料のことまではわかりませんが。



私は分冊百科(デ○ゴスティー二とかア○ェットの『週刊○○』というやつです)で欲しい号の時だけ、セブンネットショッピングで買ってました。
出版元に直接定期購読を申込むのはいいけど解約手続きでのトラブルに関する口コミを多数見るのと、毎号買う訳でもないしその都度本屋で注文するのが面倒だったこともあり、セブンネットショッピングに行き着きました。
注文した商品はきちんと梱包されてましたし、特に問題はなかったですよ。

参考になれば幸いです。