ベビーパウダーをお使いになっているので既にそこそこマットなお肌に仕上がっているのではないかと思うのですが、それだとマット感が足りないのでしょうか…？
BBクリームもBBクリームの中にファンデーションの役割が既にあるので、それ以上ファンデーションを塗る必要もないのではないかと個人的には思います。
ただ気になるのがアトピーということなので、普段どのような症状が出るのかにもよりますが、あまりマットすぎるともしかしたら乾燥しやすくなってしまうのではないかと思うのですが、その辺は平気なのでしょうか？

マット肌にするには特にパウダーファンデーションでなくても、今はリキッド・クリーム系のファンデーションでも、塗るとパウダーっぽくサラサラになる物もあるので、マット仕上がりの物を選べばマット肌にすることはできます。
クッションファンデーションにもマット仕上げの物があるので、ドラッグストアやロフトなどの店頭で探してみられてはいかがでしょうか？
メイベリンのクッションファンデは乾燥しにくいのに見た目がマットになるそうです。製品に関わらずアトピーの方がおすすめしていたメーカーの1つにエテュセがありました。お肌に優しい処方になっているそうです。
合わない場合はやめた方が良いですが参考までに。