こんばんは。
ご質問の件ですが。端石様の様々なご推察、中々いい線をいってらっしゃると思います。
多岐にわたってしまい参考になるかわからないのですが…。

【付けるファンデによっての偽装はできるか？】
できるといえばできます。
まず、ファンデがきれいにきっちりと載っていればそのファンデーション色に合ったポイントメイクの方が似合うのはむしろ当然ともいえます。だから、誤診防止のために、ベース含めメイクを落として診断を行うのが基本なわけですけれども。
パーソナルカラーは主には肌の色と、メイクや服の色との調和度合いで決まりますので。
肌色以外にも、瞳や髪の色との調和も関わってきますが、最も大きいのは肌の色です。
ファンデのトーンが合ってないと普通は経時でくすみ・くずれが目立ってくることが多いのですが、そうなりにくいものもあります。
ここまでがご質問の主旨に対する回答となるでしょうか。

ここから、以下は付随するお話内容に関しての私の見解です。
サロンでのフルメイクの際のファンデはご自身のものを持ち込みだったのかサロンのものだったのかが読んでいてもよくわからなかったのですが…

私自身はブルーベース夏、セカンド春です。カバマだとＢＯ10ですが、色々なメーカーのファンデを使いたいので、妥協できる範囲で色々使います。
ルナソルのY色番のファンデですが、私が以前持ってたのはクリームタイプですが、完全にイエローベース色でした。まあルナソル（カネボウ）だけでなく、ほとんどのメーカーのファンデは黄み・赤み・その中間、すべてイエローベース色である事がほとんどですけど。
でもルナソルのYはOCよりは、特にブルーベースで黄よりの肌の方にはなんとか合う可能性が強いです。私も展開のなかでは一番近似値色だったので無理やり使ってました（＾＾；）。
ちまたのファンデーションは殆どのものがブルー要素は抜きに設計された色展開で、その中でもブルーベースの方が合う色を妥協で選ぶならば、黄みよりあるいはピンク寄りの「両端のどちらか」が「まあまあ合う」可能性が高く、中間のオークルがもっともくすみやすいです。

【普段メイクのほうがしっくりくる理由】
で、ご質問のなかでご推察の通り、ルナソルのY色番ファンデがわりと合っておられ、質的にも合っていて崩れが少なく、さらに端石さまがもし「セカンド春」だった場合。
今までつけてらしたコーラル系のポイントメイクの方がずっと調和してみえる、というのは十分ありえますね。
しかも仰る通り若くていらっしゃるので、少々合わないファンデ、ポイントメイク色でもくすみや影ができにくい。というのもまさしくありえます。
はたまた確かに実は誤診もありえますが。
但し、オレンジ・ブラウンは日ごろから似合わない事、カバマでB色番が間違いなく合っていたという事から、その可能性は低いかもしれません(カバマのジャスミーとパーソナルカラーは別物という説がありますが、ブルー/イエローの2分割においては全く同じと私は思います)

その他…
サロンはむしろ照明環境が理想的すぎて(「演色性」が正確すぎて)、普段よくいる場所ではかえってコーラルの方が映えて見えたりなど。
また、ブルーベース色とひとくちにいっても、夏タイプに冬のピンク、ブルー等はキツ過ぎますので、正確に選ぶ必要があります。服よりは、メイクの方が夏冬共通で使える色も多いのですけど…。でも特にセカンドが春・秋の方の場合、「冬」の冴えすぎたクールな青ピンク等は濃淡問わずかなりけばけばしく浮いた感じになることも多いので、ご自身ではそういった色を付けてしまった可能性。（これも本当にものにより、ひとくちでは言えないんですけどね）

などが考えられるかなと思います。せっかくのサロン診断ですから普段の生活に生かせる結果となればいいですね。