私は使っています♪
きっかけはアルビオンの乳液を買ったときに、ＢＡさんに「コットンでつけてください」と言われてからですが・・・。
最初は質問者さんと同じように周りに乳液をコットンで使っている人を見たことがなかったので、ちょっと心配だったけれど、今では当たり前のように使っています。（アルビオン以外の乳液を使うときも）

乳液で使わないのはソフィーナジェンヌのジェル乳液を使うときくらいかなぁ。アレはさすがに手を使っています。コットンに出しても手を使ってもあまり変わりなかったので・・・。

肌質にもよるとは思いますが、コットンでつけてもいいと思います。
手でつけることに比べたら経済的には悪くなるけれど、化粧水をつけるときと同じように、コットンを使えばゆっくりつけられるし、肌にまんべんなくつけられて、浸透もいいですし。
コットンに残った分で首や手などにも使えますし。

余談ですが・・・
コスパが悪いことを気にされる場合は、化粧水やミストなどを使ってコットンを少し湿らせて乳液をコットンに出して使ったり、または乳液にほんの２、３滴オイルを混ぜて使うとのびがよくなってコスパも少しマシになりますよ。