私の場合
自分の足のサイズより少し大きめの靴を買い、中敷で大きさを調節すると足が痛くならずにすみます。
とくに外、中ともにやわらかい素材で出来ている靴ですと痛くならないようです。
今はいているのはフリオバレンチノというところの４Ｅのヒールなのですが、素材がやわらかく、もともとヒールに弱い私でも８時間の立ち仕事をしても大丈夫です。
私の足のサイズは22.5ですが、こちらのヒールは23～23.5のサイズになります。

最初から自分の足にピッタリのサイズで硬めの素材ですと、疲れで足がむくんだりしたとき、長時間履いたときにサイズや形が合わなくなってくることもあるので、すこし大き目のヒールを買って中敷で調整してみてはいかがでしょうか。

今はいているヒールに関しては、いきなり長時間長距離を履かずに１５分３０分と足を慣らしていくのはどうでしょうか。
１時間で足が痛くなるというのは、残念ながら靴があっていないように思えますので、少しずつ体をヒールに慣らしていくほかないように思われます。
普段使いにせず、特別なときにだけ履くようにするとか…。

少しでも参考になればいいのですが。