私の経験上、
原因はこの2つかと。

・靴自体が不衛生
・足の洗いすぎ

1つ目に関しては、スニーカーなら洗えるので洗ったらいいと思います。パンプスは、私は1年くらい履き続けるとどうがんばっても臭くなっちゃうので、諦めて捨てます。いちおう、靴用の除菌スプレーみたいなものは使ってますが、雨の日に濡れたり、汗を吸ったりしてどうしても菌が繁殖しやすいんですよね。

2つ目ですが、こちらは臭いを気にするあまり、洗いすぎてないですか？ということです。特にボディソープは脂分を取りすぎるのでよくないです。
私も結構足の臭いを気にして、毎日しっかりボディソープをつけて洗っていました。
そして、日中はストッキングにパンプス、という生活だったのですが、夕方には臭いが気になってパンプスを脱げない(脱いだら臭いが周囲に広がっちゃうのでww)状態でした。
ある時、足に限らずいろんなところの肌の乾燥が気になって、ボディソープを使わずお湯で流すだけにしてみたんです。そうしたら、肌の調子がよくなったのと同時に、足の臭いもなくなりました。
たぶん、必要な常在菌まで殺してしまっていたのだと思います。
もちろん、週に1度くらいは石鹸を使ったり、脚の角質取りをしたりしますが、基本は今もお湯洗いだけです。臭いが気になることはほとんどないですよ。