アリだと思います！
化粧水をつけるのがつらい程肌荒れしてる時は、つけないのも全然アリだと思いますよ。

ヒリヒリするということは、その化粧水がどんなに良い成分で出来ていたとしても今の自分の肌には刺激になってしまっているという事。
ヒリヒリは肌が止めてくれと訴えているサインです。(笑)

保湿も勿論大事ですが、絶対にやらなければならない！という観念にとらわれて肌に刺激を与え続けては本末転倒だと思います。

実際、質問者さん自身が肌の調子が良くなったと思うのであれば、その方法は正解だったという事ではないでしょうか？

大切なのは自分の肌の状態を見極めて、その状態に合ったケアをする事だと思います。

肌の状態は日々変化するものです。今は化粧水ナシで調子が良くても、ある日突然乾燥を感じたりするかもしれません。
その時々でケアの方法を変え、自分の肌に一番負担のかからない方法を見つけていく事が重要ですね。

「化粧水は肌本来の～」という件については余り気にする事もないと思います。
私達は男性に比べて化粧もしますし、昔の方に比べエアコン等の文明品などにより肌を乾燥させる機会も多いので、ある程度の化粧水によるケアは必要かと。

長々と失礼致しました。
少しでも参考になりましたら幸いです。
最終的に化粧水アリナシを判断するのは貴方のお肌だという事も忘れずに(笑)