健康やダイエットには玄米が良いと聞いて食べたことがありますが、いつもはお腹がゆるい体質なのに急に便秘になり苦しかったです。

体に合わないのでしょうか、同じ感じだった方、いますか？

今は白米にもち麦を混ぜて炊いて食べています。便通は普通です。

プロテインを摂取したときも、急に便秘になりました。

おならも多いだけでなく臭かったです。

ですので飲む量を半分にしましたが改善されず、次に4分の1に減らしましたが便秘とおならは治りませんでした。最初がホエイプロテインだったので、ソイに変えたりもしましたが駄目でした。
今は諦めて食事から摂るようにしていますが、

「あすけん」というアプリで食事を記録しているのですが、毎日たんぱく質の不足を指摘されています。

タンパク質不足で筋トレはしないほうがいいでしょうか？

筋トレを始めたら腰痛や肩こりが良くなったので、現在も継続していますが…