どちらを飲んでも保湿効果はかなり低いと思います
保湿のために使いたいなら
化粧品として顔に塗ったほうが良いでしょうね
糖質、タンパク質、アミノ酸などは水分を抱え込み
保湿効果がありますから

プロテオグリカン（ヒアルロン酸やコンドロイチンなど）は
糖とタンパク質がくっついたものなので
体内では分解され糖質、アミノ酸になります
体内で十分に分解されなければ吸収されず外に排出されます
プロテオグリカンそのままの形では体内には吸収されません

セラミドは脂質と脂肪酸が結合した物質（スフィンゴ脂質）です
こちらもプロテオグリカンのように体内（小腸）で分解されますが
植物由来のスフィンゴ脂質は分解効率が低く消化しにくいので
そのまま体外に排出される可能性が高いです
マウスの実験では人工的にアトピーや角質を壊した後
セラミドを食べさせると
セラミドを合成する酵素の働きが上昇したという報告はありますが
それによりセラミド自体が増えたかどうかは不明です

アトピーの方はセラミドやプロテオグリカンが作られる量が少なかったり
それを作る酵素の機能が低下していたり
作ることはできていても欠陥のあるものしかできない
ということのようなので
原料がたとえ外からたくさん補給されても
それらを使って目的のものがたくさん作られるとは限りません