お薬を選ぶのは難しいですよね
体質、そのときの体調や免疫力低いなどで、正しく服用しても副作用が出ますね

コッコアポEX(防風通聖散)を服用するようになり2週間近くになる
お通じはよくなったものの、腹痛によって出すほうが多い
服用をやめる、または減らすべきか

服用をやめたほうが良いです
服用を中止して、病院で診察を受けてください

コッコアポEX（防風通聖散）は、
胃腸が弱い、体力がない、体が弱い、汗かきの人には、激しい腹痛を伴う下痢などの副作用があらわれやすい等、不向きとされます

まれに重い副作用として、肝機能障害、間質性肺炎、偽アルドステロン症、腸間膜静脈硬化症が起きることがあります

質問者様の場合、腸間膜静脈硬化症の疑いがあります
症状は、腹痛、下痢、便秘、腹部膨満などが繰り返しあらわれます

お薬の服用はやめて、一刻も早く病院で診てもらうことをおすすめします
防風通聖散は便秘、肥満、高血圧に伴う症状に適するものなので、併せてその対策も相談されると尚良いかと思います