内容は同じです。
処方薬も殆どがクラシエかツムラだと記憶しています(元薬局事務)
私は常時飲むものは内科で処方箋出してもらって保険適用で購入(というのもおかしいですが)していました。
Amazon等も購入出来ますが自費(10割計算)と同じなので、常用するのなら処方箋出してもらうのをおすすめします。
稀に漢方調剤してくれる薬局ありますがアソコは多分保険適用外だった気もするので、「防風通聖散」と決まってるのなら内科でいいかなと思いますよ。
内科でも漢方に精通されているドクターなら色々診察して貴女の体質(陰か陽か等)によりどれをオススメするかなど決めていただけるので。

漢方は西洋薬と違い、根本から整えて行くので(西洋は対処療法)時間はかかります。1箱分で効果が出るのは数少ないとご承知おき下さい。